آنالیز رونوشت ها، ایجاد شبکه پروتیینی و تعیین عملکرد آنها در باسیلوس سابتلیس تحت استرس h2o2 و اکسیداتیو

موجودات پروکاریوت موجوداتی هستند که در آنها غشای مشخص و سازمان یافته وجود ندارد. در واقع در این موجودات اطراف هسته غشا وجود ندارد و کل ماده ژنتیکی باکتری در ناحیه هسته مانندی در داخل سلول باکتری قرار می گیرد. باکتری باسیلوس سابتیلیس عضوی از خانواده باکتری های گرم مثبت می باشد که عموما در خاک زندگی می کند اما گزارشات مختلف نشان می دهد که این باکتری می تواند تقریبا در هر محیطی زندگی کند. این موجود به خاطر پروکاریوت و تک سلولی بودن می تواند در فرآیندهای مختلف بیوتکنولوژیک مورد استفاده قرار گیرد. از جمله فعالیت هایی که این باکتری می تواند در آنها نقش داشته باشد می توان به تولید بسیاری از آنزیم های صنعتی مثل پروتئاز، لیپاز و غیره، تولید آنتی بیوتیک های مختلف و همچنین تولید پروتیین های انسانی اشاره کرد. متابولیسم این باکتری می تواند تحت تاثیر عوامل مختلف قرار بگیرد. این عوامل می توانند تاثیرات مثبت و منفی روی متابولیسم داشته باشند. در این مطالعه با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی تاثیر استرس های مختلف مانند استرس اکسیداتیو و استرس پاراکوات و استرس فقدان گلوکز بر روی متابولیسم مورد بررسی قرار گرفت و ژن هایی که نقش کلیدی را در پاسخ به استرس ایفا می کنند. آنالیزهای بیوانفورماتیکی شامل استفاده از پایگاه های داده مشخصی می باشند که اطلاعات مربوط به این مطالعه از آنها به دست آمد و در مرحله بعد استفاده از نرم افزارهایی که یک سری محاسبات آماری روی اطلاعات انجام می دهند. همچنین یک سری از نرم افزارها نیز وجود دارند که شبکه ژنی ژن های تحت تاثیر استرس را رسم می کنند. در استرس اکسیداتیو ژن هایی که مربوط بودند به تحرک باکتری دارای نقش مرکزی در شبکه بودند. در استرس پاراکوات ژن های درگیر در فرآیند انتقالات از عرض غشا نقش چشمگیری را ایفا می کنند. کمبود گلوکز نیز اثرات بدی بر روی متابولیسم باکتری دارد به طوری که تنها در حضور گلوکز است که باکتری می تواند آنتی بیوتیک یا آنزیم تولید می کند.